Quadratic Binding Fit

Liu Lab Kd拟合工具

保留原始严格二次结合模型,同时新增误差棒、曲线点位导出、以及可选 PNG/JPG 和 PPI 的图片导出。 (Retains the original strict quadratic binding model, while adding error bars, curve point export, and optional PNG/JPG and PPI image export.)

v0.22

Kd 计算原理:基于二次结合模型,用实验浓度 X 与信号 Y 的关系进行非线性拟合,求出最能解释数据的解离常数 Kd。 (Kd calculation principle: based on the quadratic binding model, the program performs nonlinear fitting on the relationship between experimental concentration X and signal Y to obtain the dissociation constant Kd that best explains the data.)

Excel 风格表格 支持手动方差 支持重复数据自动算误差棒 支持曲线 CSV 导出与图片导出

Model

Y = Ybase + alpha * [AT]

[AT] = 0.5 * (X + fixed + Kd - sqrt((X + fixed + Kd)^2 - 4 * X * fixed))

X     = 可变一方总浓度 (Total concentration of the variable component)
fixed = 另一方固定总浓度 (Total concentration of the fixed component)
Kd    = 解离常数 (Dissociation constant)

Y free拟合:Ybase作为自由参数进行拟合,允许背景信号浮动以获得最佳拟合。 (Y free fit: Ybase is fitted as a free parameter, allowing the background signal to float for optimal fit.)

Y fixed拟合:Ybase固定为用户指定的值,通常用于已知背景信号的情况。 (Y fixed fit: Ybase is fixed to a user-specified value, typically used when the background signal is known.)

参数与导出 (Parameters and Export)

导出曲线的取样点数默认 1000;图片导出按所选 PPI 等比例放大像素尺寸。 (Default sampling points for exported curves: 1000; Image export scales pixel size proportionally based on selected PPI.)

主表可直接粘贴 Excel 的两列或三列数据。误差棒为“手动方差”模式时,第 3 列填写 Var(Y),程序用 sqrt(Var) 作误差棒长度。

重复数据模式时,请在下方“重复数据表”输入 X、Y1...Yn。每行至少需要 2 个重复值,程序使用样本方差计算误差棒。

已载入示例数据,可直接点击“开始拟合”。

拟合结果 (Fitting Results)

同时给出 Ybase 自由拟合和 Ybase 固定拟合的结果。 (Provides results for both Ybase free fit and Ybase fixed fit simultaneously.)

主数据表 (Main Data Table)

支持粘贴 Excel 两列或三列:X、Y、Var(Y)。 (Supports pasting two or three columns from Excel: X, Y, Var(Y).)

序号 (Index) 浓度 X (Concentration X) 信号 Y (Signal Y) 方差 Var(Y) (Variance Var(Y)) 操作 (Action)

重复数据表 (Replicate Data Table)

在“输入 n 组数据自动计算”模式下使用。每行填一个浓度及其重复信号。

拟合曲线 (Fitted Curve)

黑点为数据点,蓝色误差棒为误差,红色实线为自由拟合,蓝色虚线为固定拟合。 (Black dots are data points, blue error bars are errors, red solid line is free fit, blue dashed line is fixed fit.)

点击“开始拟合”后,这里会显示拟合曲线。
数据点 (Data Points) Ybase 自由拟合 (Ybase Free Fit) Ybase 固定拟合 (Ybase Fixed Fit)